El Programa Empretec se instala en Uruguay en el año 1989, a través de un acuerdo entre Naciones Unidas y el Banco de la República, quien oficia desde entonces como contraparte nacional.
En 1993 se crea la Asociación Empretec Uruguay, una asociación civil sin fines de lucro que tiene desde entonces la responsabilidad por el funcionamiento del Programa.
Sus funciones principales son: la identificación de oportunidades de inversión, el desarrollo de actividades tendientes al mejoramiento empresarial, y la constitución y desarrollo de empresas; la facilitación de las relaciones de los empresarios en el mercado local y externo, el apoyo a emprendimientos y actividades que fomenten la innovación, la tecnología y el óptimo aprovechamiento de recursos naturales y el mejoramiento de la calidad de productos y servicios.